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码住!这绝对是最易懂的流式细胞实验设计指南!说到流式细胞,从个人角度上来说,它的实验高速客观,不仅具有统计学意义,能够处理复杂样本并同时获取多种参数,而且最关键的是它性能可靠,可重复性非常好!比起传统的细胞生物学研究手段来讲完全是秒杀的存在了;如果把共聚焦和膜片钳算进去,完全可以说是三足鼎立 ~ 但是很多身边的同学反应,在实验中经常有细胞实验失败或数据不理想,小编想了想,最常见的问题应该就是对照设置不合理导致的。因此,今天我们来谈谈成功的流式细胞实验设计都需要设置哪些对照。 如果你掌握了流式实验如何设置对照的精髓,实验成功率一定会上升的。 基本流式对照有5 种:空白对照、生物学对照,同型对照及补偿对照(也叫单阳性对照)和 FMO 对照,其目的是为了避免出现假阳或假阴性的结果。 比如凋亡实验,我们来看看如何设置对照组。下图是 Annexin V/PI 检测凋亡的原理示意图。
Annexin V/PI 检测凋亡的原理示意图
假设两组细胞,一组是用药物处理(Treat 组),另一组用 DMSO 溶剂(Vehicle 组),拟用 Annexin V/PI 检测凋亡,那么需要设置哪些对照呢? 1、生物学对照 其实上述的 Vehicle 组就是生物学对照组。 2、空白对照 在流式上机检测前,我们还需准备额外一组什么染料也不加的细胞当空白对照。因为除了阳性荧光信号之外,我们还需要排除是不是样本本身就自带荧光的背景,所以要设置空白组来验证在各个检测通道上的信号是否都是阴性。 3、同型对照(Isotype control) 众所周知,抗体是个 Y 字形的,Fab 区域是特异性识别抗原的。在做蛋白免疫印迹时只需考虑 Fab 的特异性,但是做细胞的话就有点不同了,因为特别是免疫细胞,它们表面有 Fc 受体,所以这个同型对照是为了评估抗体 Fc 段和靶细胞的结合情况。
对比图
所以在做免疫细胞的流式检测时,我们通常都需要加入 Fc 受体封闭剂,之后再加入目标抗体的 isotype 作为同型对照,来排除细胞 Fc 受体造成的假阳性结果。 4、补偿对照(单阳性对照) 首先来看看什么是荧光补偿。
补偿对照(单阳性对照) 就是使用几种颜色的抗体,就需要设置几种颜色的单阳性对照。这里推荐用补偿微球来作为补偿对照,一是能节约时间和样本,二是,有时候自己做的单阳性对照效果不佳,阳性信号不强,就失去了补偿对照的意义了。
补偿微球的效果 5、荧光减一(FMO,Fluorescence minus one)对照 假设有三种以上颜色的话,就需要再设置 FMO 对照来评估其他荧光染料的干扰和补偿本底,帮助正确设置阳性门。下图演示如果按空白对照组设定界线之后得到的细胞比例比 FMO 设定的值要大。从这个图可以看出,空白对照仅仅是设定阴性界线,但非阴性并不等于就是阳性,所以还需 FMO 来设定阳性界线。
荧光减一(FMO,Fluorescence minus one)对照
综上所述,如果只检测两种颜色的话,至少需要 5 个对照(生物学对照 空白对照 同型对照 2 个单阳性对照)。如果要检测 3 种颜色的话,我们来算算,生物学对照 空白对照 同型对照(可以不同的 isotype 做在同一管里) 3 个单阳性对照 3 个 FMO 对照,一共需要 9 个对照。
荧光减一(FMO,Fluorescence minus one)对照
要是感兴趣的同学比较多,我们下次再继续谈谈样本处理和颜色搭配的问题。 |